亚马孙生态被破坏将威胁着全球公共卫生，这是目前全球环境保护研究组织关注和担心的问题。
经过IOC/Fiocruz科学家领导的一项研究发现，巴西存在被大流行病侵袭的风险，因为与狩猎乱砍伐等相关的173种病原体（病毒、细菌、蠕虫、寄生虫、真菌），这些病原体可导致人类患上76种疾病。
研究表明，没有人能对滥伐亚马孙地区引发的病毒传染免疫，文章总结了整个巴西都存在风险，但亚马孙周遭更容易传染。它具备一场被大流行风暴侵袭的所有条件。拥有世界上最多的多样性陆地生物，创纪录的森林砍伐率（15年来最高）和偏远城市的人口难以获得医疗服务都有关联，随着国家环境和社会状况的恶化，疾病出现的风险大增。最容易爆发疫情的地方是靠近森林砍伐地区的亚马孙周遭城市。
由于森林砍伐接近定居点，许多动物失去了栖息地。那么在森林中保持病毒和其他病原体安全的动态平衡将被打破，这就存在人畜共患病的风险。
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