今年1月份以来，由于新冠肺炎和流感同时进入高发期，巴西三家主要航空公司出现机组人员短缺的情况，数百个国内和国际航班因此被取消。巴西国家民航管理局（Anac）表示，“正在对飞行员、空乘人员和其他航空从业人员的呼吸道疾病情况进行监测”。

Latam航空公司通知乘客，1月份所有国内和国际航班已经被取消了1%，从本周一（10日）到周日（16日），至少有111个班次被取消。在一份声明中，公司对这种情况表示遗憾，并指出“这完全超出了企业的控制范围。公司建议乘客在前往机场之前，务必在官网上查看确认航班状态”。

Gol航空公司也证实，最近几天“员工中的阳性病例有所增加”，但表示“并没有因此造成航班取消或发生班次重大变化的情况。检测结果呈阳性的员工均会被调离岗位，安全地留在家中修养康复。”

根据全国航空从业人员工会（SNA）的统计，与过去12个月的平均数字相比，Azul航空公司1月份因病缺勤的人数增加了405%。公司表示，会向接受放弃休假的员工提供额外的现金奖励。航空从业人员工会主席杜特拉（Ondino Dutra）透露，在同工会的一次会议上，Azul公司代表曾提到有计划取消“数百个航班”，主要集中在1月下旬。

但在正式声明中，Azul则表示：“公司90%的业务都正常运转。”声明还说，“由于运营方面的原因，1月份的一些航班被重新安排。公司发现机组人员当中因病缺勤的数量出现增长，但所有人员基本都症状轻微。企业也在密切关注巴西和全球流感和新冠肺炎病例的增加。”本周日（9日）至周一（10日），Azul的枢纽机场维拉科普斯机场至少有53个航班被取消。

根据巴西民航局的规定，航空公司在起飞前72小时内取消航班时，乘客有权要求全额退还机票款，或免费安排到同公司或其他航空公司的航班。